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Procede del euskera y vendría a significar «lugar abundante en leña»: abar, «rama», zur, «madera», tzu, sufijo abundancial, y -tza, sufijo abundancial o locativo. Según el censo del INE de 1842, el municipio se denominó Abarzuza y Anderaz, siendo Anderaz el nombre de un barrio de Abárzuza. En 2011 adoptó la denominación cooficial Abartzuza.
Históricamente el lugar se ha relacionado con García Jiménez de Pamplona y con los orígenes legendarios del reino de Navarra, e incluso se ha remontado su fundación al siglo II, aunque eso pertenece a la tradición. Ya en el siglo XI pertenecía al señorío temporal de la catedral de Pamplona. Sancho VII de Navarra concedió a esa iglesia en 1189 el sello o jurisdicción sobre la villa, que el obispo Pedro de París había adscrito en 1193 al naciente monasterio de Santa María la Real de Iranzu, donación que corroboró en 1201 el prelado García Fernández. Los collazos del lugar debían pagar a la abadía una pecha anual de 400 sueldos.