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El municipio toma el nombre de su cabecera, que hasta mediados del siglo XIX aparecía también como Lagaete, contracción de «El Agaete» o «La Agaete», que es como figura en documentos de los siglos XV y XVI. El origen más aceptado lo hace un topónimo aborigen canario. Sabin Berthelot lo compara con la voz «aǐgaǐte» del dialecto siwi, «cordero»; Juan Álvarez Delgado propone traducirlo como «el roque o roquete», con referencia original al roque de las Nieves; para el filólogo Ignacio Reyes podría traducirse literalmente como «hondura, cuenca», y por extensión «charca, depósito natural, lago pequeño», «escorrentía, río» o «valle».
Otra versión, recogida de la tradición por Juan del Río Ayala y Antonio Doreste García, lo hace derivar de la corrupción del castellano «laguete», diminutivo de «lago», aludiendo al pequeño lago que se formaba en la desembocadura del barranco de Agaete. Una tercera, la del historiador Tomás Arias Marín de Cubas, hace derivar la voz de la italiana «Gaeta», nombre dado a la playa del valle por sicilianos que habrían llegado a la isla antes de la conquista castellana.
Agaete está en la isla de Gran Canaria; destacan su cabecera y el puerto de Las Nieves. En las fuentes consultadas no hay más datos sobre la historia del nombre.