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Es un topónimo de origen y significado inciertos. Se ha relacionado con arrano, «águila», (h)aran, «valle», o aran, «endrina», y se han dado significados como «colina del valle», «lugar de endrinos» o «lugar del valle». Mikel Belasko da más verosimilitud a la propuesta de Koldo Mitxelena, (h)aran, «valle», con el sufijo diminutivo -no, es decir, «pequeño valle», y apunta que Arano está documentado como nombre de pila de varón en la Navarra del siglo XVI, por lo que podría ser un antropónimo. Pascual Madoz recogió una etimología popular según la cual venía de hara noa, «allá voy».
Arano dependió de la vecina villa de Goizueta hasta 1630, cuando el rey Felipe IV le concedió la gracia de separarse y erigirse en villa independiente a cambio de 700 ducados. En 1982 se trasladó a su término la histórica empresa donostiarra Cervezas El León, fundada en 1913, para aprovechar un manantial de agua, llamado Arula, de cualidades muy favorables para fabricar cerveza.