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La parroquia de Santo Tomás de Arrazua y con ella la anteiglesia se fundaron en el siglo XIII por el dueño de la casa solar de Arrazua, de la que tomarían el nombre. Es muy probable que etimológicamente signifique «el barrancal», del vasco arro, «barranco», el sufijo -tzu, de abundancia, y el artículo -a. Tradicionalmente se llamó Arrazua, y en la reforma de la nomenclatura municipal de 1916, a propuesta de la Real Sociedad Geográfica, que quería acabar con los municipios del mismo nombre, tomó el de Arrazua de Vizcaya, pues había otro homónimo en Álava. En euskera se pronuncia Arratzu, y al recuperar su independencia en 1993, desanexionándose de Gernika y Lumo, se estableció como denominación oficial única.
La parroquia de Santo Tomás de Arrazua, y con ella la anteiglesia, se fundaron en el siglo XIII por el dueño de la casa solar de Arrazua. El municipio recuperó su independencia en 1993, al desanexionarse de Gernika-Lumo.