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Hacia 1290 se menciona como Bernuy de Spiritu, por su cercanía a Espirdo, y como Bernuy de Ruviales, por la cercanía del despoblado de Rubiales; en el siglo XVI ya aparece como Bernuy de Porreros. Bernuy remite al nombre del repoblador que fundó el lugar. Podría derivar del nombre godo Bermudus, formado por baira, «oso», y mods, «coraje, valor», o de Bern-hart con una terminación -uy de origen vasco que indica lugar, con el sentido de «lugar de Bernardo». Esa terminación también podría señalar influencia aragonesa y repobladores venidos de Beranuy, en Huesca. Porreros deriva del latín porrum, «puerro», con el sufijo de oficio -ero, y alude al cultivo de puerros, ya fuera porque algunos vecinos se dedicaban a ello o porque sus campos eran buenos para esa planta.
A mediados del siglo XIX el lugar tenía 213 habitantes y aparece descrito en el cuarto volumen del Diccionario geográfico-estadístico-histórico de Pascual Madoz.