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El nombre procede del vasco Berrio zahar, «Berrio viejo». En el Libro de Rediezmo de 1268 aparecen tres poblaciones con el nombre de Berrio: Berruoçarr (la actual Berriozar), Berrio de Sus (Berriosuso) y Berrio de Ius (Berrioplano). Por eso se cree que Berriozar fue la primera de las tres y la que llevó simplemente el nombre de Berrio hasta que surgieron las otras dos. El propio Berrio se ha relacionado con el castellano barrio y con el vasco berri, «nuevo».
La primera noticia de Berriozar es el Libro de Rediezmo de 1268, que lo cita como núcleo de 8 fuegos o casas, unas 40 personas. Un documento de 1205 menciona el topónimo Berrio sin distinguir todavía entre Berrio de la Plana, Berrio de Sus y Berrio Zaharr. Es posible que antes del siglo XIII hubiera en el término algunas corralizas y casas de labranza que se usaban en épocas de paz y se abandonaban en las de guerra, cuando la población se refugiaba en el recinto amurallado de Pamplona.