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Narón es un hidrónimo de origen prerromano, es decir, un nombre de río o de curso de agua. Se explica a partir de la forma paleoeuropea nar-, derivada de una raíz indoeuropea que significa «penetrar», «sumergir», «esconder» o «hueco», que identificó el lingüista Pokorny y que relacionó con varios ríos bálticos. Filólogos como Bascuas han defendido ese origen, que sería un ejemplo de la alternancia de formas en -a y en -ón, característica de la hidronimia paleoeuropea. De la misma serie serían los ríos Neira, Naraya, Narayola y Narcea, y otros nombres como Naraval, Naraío, Naraído o Naraxa.
Otros autores lo han derivado de un nombre de persona, Naro o Naronius, pero esa explicación está menos respaldada. Según la Galipedia, el nombre vendría de una raíz preindoeuropea nar-, que significa «agua» o «curso de agua».
El municipio tomó el nombre de San Xiao de Narón, por donde pasa el río Salgueiro, porque allí se reunía el concejo en el siglo XIX. Hasta la constitución del concejo de Narón, en 1837, el territorio que hoy ocupan Narón, Ferrol, San Sadurniño, Valdoviño y Neda se conocía como Trasancos.