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Julio Caro Baroja lo consideraba un antropónimo procedente de un nombre latino Aramaeus ('arameo'), que no está documentado, o de otro parecido como Alamaeus, Alabaeus o Arabaeus. Según esa hipótesis, una villa Aramaiona sería la propiedad de ese personaje.
Las menciones más antiguas son del siglo XIV y ya aparecen las formas actuales: la castellana Aramayona, la vasca Aramayo y una intermedia, Aramayon. El castellano habría conservado una forma más conservadora, mientras que en euskera se perdió la n intervocálica y se redujo oa a o (Aramayona, Aramayo(n)a, Aramayo(a)). Hoy se pronuncia localmente Aramaixo, con una fricativa prepalatal sorda, pero la forma normalizada en euskera es Aramaio, que es también el nombre oficial.
El municipio tuvo como precursora la hermandad de Aramayona. A mediados del siglo XIX su término integraba Aréjola, Azcoaga, Barajuén, Echagüen, Ganzaga, Ibarra (la capital), Zalgo, Olaeta, Uncella y Uríbarri, y tenía contabilizados 1.827 habitantes. Lo describe así el segundo volumen del diccionario de Pascual Madoz.