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Según la edición en euskera de Wikipedia, Laudio procede casi con seguridad del nombre de persona romano Laudius. Otras teorías, de base menos sólida, lo hacen venir del nombre romano Claudius (pero eso habría dado Cloyo en castellano) o de Flaudio, hipótesis defendida por Julio Caro Baroja, aunque después se supo que no existió un nombre romano Flaudio.
La pronunciación tradicional en euskera es de tres sílabas, /lau-dí-o/; en los últimos años, por influencia del castellano, se ha extendido la de dos, /láu-dio/, que se considera impropia del euskera cuidado. Laudio es el nombre oficial en euskera y Llodio en castellano.
Los orígenes históricos de Llodio no están claros. El vestigio más antiguo de la localidad es el puente medieval de Vitorica sobre el río Nervión, del que queda un arco. Habría formado parte de la calzada que unía la Llanada Alavesa con el puerto romano de Flaviobriga. Fue reconstruido en la Edad Media y casi cambiado por completo, y parte de su estructura se dañó en las inundaciones de 1983.